Bab. IV.
Glikolisis
17.1 Jalur keseluruhan
Glikolisis
Glikolisis adalah tahap metabolisme glukosa dalam organisme dari bakteri ke
manusia, dan itu adalah jalur biokimia. Pada glikolisis, satu molekul glukosa diubah menjadi
fruktosa-1 ,6-bifosfat selanjutnya menghasilkan dua molekul piruvat
(Gambar. 4.1). Jalur glikolisis (juga disebut jalur
Embden-Meyerhoff) melibatkan banyak langkah, termasuk reaksi di mana metabolit glukosa
yang teroksidasi. Setiap reaksi dalam jalur dikatalisis
oleh enzim spesifik. Dalam setiap dua reaksi dalam jalur
metabolisme glikolisis satu molekul
ATP dihidrolisis
untuk setiap dimetabolisme molekul glukosa. Dalam setiap dua reaksi lain, dua
molekul ATP yang diproduksi oleh fosforilasi
ADP untuk setiap molekul glukosa, memberikan hasil total empat molekul ATP. Sebuah perbandingan jumlah molekul ATP
digunakan dengan hidrolisis (dua) dan jumlah yang dihasilkan (empat) menunjukkan
bahwa output
mendapatkan dua molekul ATP untuk setiap molekul glukosa yang
diproses dalam glikolisis. Glikolisis memainkan peran
kunci dalam organisme melakukan cara mengekstrak energi
dari nutrisi.
Gambar. 4.1. Satu molekul glukosa diubah menjadi dua molekul piruvat. Dibawah kondisi aerobik, piruvat dioksidasi menjadi CO2 dan H2O oleh siklus asam
sitrat dan fosforilasi oksidatif. Sedangkan dibawah kondisi anaerob, laktat yang
dihasilkan terutama dalam otot.
Fermentasi alkohol terjadi pada ragi.
NADH yang
dihasilkan dalam konversi glukosa
untuk piruvat yang reoksidasi ke NAD+ di reaksi berikutnya dari piruvat.
Ketika piruvat
yang terbentuk, dapat memiliki salah satu dari beberapa bahan
fates (Gambar.
1). Di metabolisme aerobik dengan adanya oksigen
terjadi piruvat kehilangan karbon dioksida.
Sisa dua atom karbon menjadi berikatan
dengan koenzim A sebagai kelompok asetil untuk membentuk asetil-KoA,
yang kemudian memasuki siklus asam sitrat. Ada dua bahan
fates untuk piruvat
dalam metabolisme anaerobik (tidak
adanya oksigen). Dalam organisme mampu fermentasi
alkohol dengan cara fermentasi piruvat yang
kehilangan karbon dioksida menghasilkan asetaldehida yang pada gilirannya
direduksi
menghasilkan etanol. Lemak
dari piruvat lebih umum dalam metabolisme anaerobik yakni reduksi untuk menghasilkan laktat, yang disebut anaerobik glikolisis untuk
membedakannya dari konversi glukosa menjadi piruvat, yang
hanya disebut glikolisis. Metabolisme anaerobik adalah sumber energi hanya di sel darah
merah mamalia, serta di beberapa jenis bakteri, seperti Lactobacillus dalam asam susu dan Clostridium
botulinum pada makanan kaleng yang tercemar.
Pada semua reaksi, konversi glukosa menjadi produk reaksi
oksidasi, yang memerlukan reaksi reduksi yang menyertainya di mana NAD +
diubah menjadi NADH. Rincian glukosa untuk piruvat dapat
diringkas sebagai berikut:
Glukosa
(enam
atom karbon) → 2 Piruvat (Tiga atom karbon)
2ATP
+ 4ADP
+ 2Pi → 2ADP + 4ATP (Fosforilasi)
Glukosa + 2ADP + 2Pi →
2 Piruvat + 2ATP (hasil
reaksi)
Gambar. 4.2
menunjukkan urutan reaksi dengan nama-nama senyawa.
Langkah reaksi
glikolisis.
Langkah 1. Fosforilasi glukosa
untuk memberikan glukosa-6-fosfat
(ATP adalah sumber dari gugus fosfat).
Glukosa
+ ATP → Glukosa-6-fosfat + ADP
Langkah 2. Isomerisasi glukosa-6-fosfat
untuk memberikan fruktosa-6-fosfat.
Glukosa-6-fosfat
→
Fruktosa-6-fosfat
Langkah
3. Fosforilasi fruktosa-6-fosfat
untuk menghasilkan fruktosa-1,6-bisfosfat (ATP adalah sumber dari gugus fosfat).
Fruktosa-6-fosfat
+ ATP → Fruktosa-1,6-bifosfat + ADP
Langkah 4. Pembelahan fruktosa-1,6-bifosfat untuk menghasilkan dua fragmen 3-karbon,
gliseraldehida-3-fosfat dan
dihidroksiaseton fosfat.
Fruktosa-1,6-bifosfat →
gliseraldehida-3-fosfat
+ Dihidroksiaseton fosfat
Langkah 5. Isomerisasi dihidroksiaseton fosfat
menghasilkan gliseraldehida-3-fosfat. Dihidroksiaseton fosfat
gliseraldehida 3-3-fosfat
Langkah 6. Oksidasi (dan fosforilasi) dari gliseraldehida-3-fosfat untuk menghasilkan 1,3-bisfosfogliserat.
Gliseraldehida-3-fosfat
+ NAD+ + Pi → NADH+ 1,3-bisfosfogliserat + H+
Langkah 7. Transfer gugus fosfat
dari 1,3-bisfosfogliserat ke ADP
(Fosforilasi
ADP menjadi ATP) untuk menghasilkan 3-bisfosfogliserat.
1,3-bisfosfogliserat + ADP → 3-bisfosfogliserat + ATP
Langkah 8. Isomerisasi 3-bisfosfogliserat memberikan 2-bisfosfogliserat.
3-bisfosfogliserat → 2-bisfosfogliserat
Langkah 9. Dehidrasi dari 2-bisfosfogliserat untuk memberikan fosfofenolpiruvat.
2-fosfogliserat → fosfofenolpiruvat +
H2O
Langkah 10. Pemindahan gugus
fosfat dari fosfofenolpiruvat ke ADP (Fosforilasi ADP menjadi ATP) untuk menghasilakan piruvat.
fosfofenolpiruvat +
ADP → Piruvat + ATP
Perhatikan bahwa hanya satu dari 10 langkah pada jalur ini melibatkan reaksi
transfer elektron.
Gambar.
4.2. jalur glikolisis. (1) Fosforilasi glukosa dan konversi untuk dua molekul gliseraldehida-3-fosfat, 2 ATP digunakan
untuk mendorong reaksi ini.
(2). Konversi gliseraldehida-3-fosfat untuk piruvat dan pembentukan ditambah dari
empat molekul ATP.
KONVERSI ENAM KARBON GLUKOSA UNTUK TIGA
KARBON
GLISERALDEHIDA-3-FOSFAT
Langkah pertama dari jalur glikolitik mempersiapkan transfer elektron
dan akhirnya
fosforilasi ADP; reaksi ini
memanfaatkan energi bebas hidrolisis ATP. Gambar.
4.3. meringkas bagian dari jalur, yang sering disebut fase persiapan glikolisis.
Reaksi mengubah glukosa-6-fosfat
menjadi gliseraldehida-3-fosfat:
Langkah 1. Glukosa
terfosforilasi untuk memberikan glukosa-6-fosfat. Itu
fosforilasi glukosa merupakan reaksi endergonik.
Glukosa
+ Pi → Glukosa-6-fosfat + H2O ΔG°' =
13,8 kJ mol-1 = 3,3 kkal mol-1
Hidrolisis ATP adalah eksergonik.
ATP
+ H2O → ADP + Pi;
ΔG°' =
-30,5 kJ mol-1 = -7,3 kkal mol-1
Dua reaksi yang digabungkan, sehingga keseluruhan reaksi adalah jumlah dari
dua dan
merupakan
eksergonik.
Glukosa
+ ATP → Glukosa-6-fosfat + ADP
ΔG°' =
(13,8 + -30,5) kJ mol-1 = -16,7 kJ mol-1 = -4,0 kkal mol-1
Ingat bahwa ΔGo’ dihitung dibawah keadaan standar dengan konsentrasi
semua reaktan dan produk 1 M kecuali ion hidrogen. Jika
melihat yang sebenarnya ΔGo’ dalam sel, jumlahnya bervariasi tergantung pada jenis
sel dan keadaan metabolik, tetapi nilai khas untuk reaksi ini adalah -33,9 kJ mol-1
atau -8,12 kkal mol-1. Dengan demikian reaksi biasanya lebih
menguntungkan dalam kondisi selular. Tabel. 1 memberikan ΔG°'
dan nilai-nilai ΔG untuk semua reaksi glikolisis anaerobik dalam
eritrosit.
Reaksi ini mengilustrasikan penggunaan energi kimia
awalnya diproduksi oleh oksidasi nutrisi dan akhirnya terjebak oleh fosforilasi
ADP menjadi ATP. Ingat bahwa ATP tidak mewakili energi yang tersimpan, hanya
sebagai arus listrik tidak mewakili energi yang
tersimpan. Energi kimia nutrisi dilepaskan oleh oksidasi dan dibuat tersedia
untuk digunakan langsung pada permintaan oleh energy sebagai ATP. Enzim yang mengkatalisis reaksi ini adalah heksokinase.
Kinase panjang adalah diterapkan pada kelas enzim ATP-dependent yang
mentransfer gugus fosfat dari ATP ke substrat. Substrat heksokinase tidak selalu glukosa;
melainkan, bisa salah satu dari sejumlah heksosa,
misalnya glukosa, fruktosa, dan manosa. Glukosa-6-fosfat
menghambat aktivitas heksokinase,
ini adalah titik kontrol di jalur tersebut. Beberapa organisme atau jaringan berisi
beberapa isozim dari heksokinase. Satu isoform dari heksokinase ditemukan di
hati manusia, disebut glukokinase, menurunkan kadar glukosa darah setelah seseorang
makan.
Glukokinase hati membutuhkan tingkat substrat jauh lebih tinggi untuk
mencapai jenuh dari tidak terbentuk heksokinase. Karena itu, ketika tingkat glukosa yang tinggi, hati
dapat
memetabolisme glukosa melalui glikolisis secara istimewa untuk dilimpahkan jaringan lain. Ketika tingkat glukosa rendah, heksokinase masih aktif di semua jaringan.
memetabolisme glukosa melalui glikolisis secara istimewa untuk dilimpahkan jaringan lain. Ketika tingkat glukosa rendah, heksokinase masih aktif di semua jaringan.
Perubahan konformasi besar terjadi di heksokinase ketika
substrat terikat. Telah ditunjukkan oleh kristalografi sinar-X, dengan tidak adanya
substrat, dua lobus enzim yang mengelilingi situs
pengikatan yang cukup jauh terpisah. Ketika glukosa terikat, kedua lobus bergerak
lebih dekat bersama, dan glukosa menjadi hampir sepenuhnya dikelilingi oleh protein
(Gambar. 4.4). Jenis perilaku adalah konsisten dengan teori tindakan induksi
enzim. Dalam semua kinase yang struktur diketahui, celah
menutup ketika substrat terikat.
Langkah
2. Glukosa-6-fosfat berisomerisasi untuk menghasilkan fruktosa-6-fosfat. Glukosefosfat Isomerase adalah enzim yang mengkatalisis reaksi ini. C-1 gugus
aldehida glukosa-6-fosfat direduksi
dengan gugus hidroksil, dan C-2 gugus hidroksil teroksidasi menghasilkan
gugus keton fruktosa-6-fosfat, tanpa bersih oksidasi atau reduksi.
Bentuk-bentuk terfosforilasi, glukosa-6-fosfat
dan fruktosa-6-fosfat masing-masing adalah
aldosa dan ketosa.
Langkah 3. Fruktosa-6-fosfat lebih lanjut
terfosforilasi menghasilkan fruktosa-1,6-bifosfat. Seperti dalam reaksi pada Langkah 1,
reaksi endergonik dari fosforilasi fruktosa-6-fosfat digabungkan
dengan reaksi eksergonik hidrolisis ATP,
dan reaksi
keseluruhan eksergonik. Lihat Tabel.4.1.
Reaksi dimana fruktosa-6-fosfat
terfosforilasi untuk menghasilkan
fruktosa-1,6-bifosfat adalah satu di mana gula mengarah ke glikolisis.
Glukosa-6-fosfat dan fruktosa-6-fosfat dapat berperan dalam jalur lainnya, tetapi fruktosa-1,6-bifosfat tidak. Setelah
fruktosa-1,6-bifosfat terbentuk dari
gula asli, tidak ada jalur lain yang tersedia, dan molekul harus menjalani sisa reaksi glikolisis. Fosforilasi fruktosa-6-fosfat sangat
eksergonik dan tidak dapat diubah, dan
enzim fosfofruktokinase, enzim yang mengkatalisis itu, adalah
enzim pengatur kunci dalam
glikolisis.
Fosfofruktokinase merupakan
tetramer yang mengikuti aturan umpan balik alosterik. Ada dua jenis subunit,
dilambangkan M dan L, yang dapat bergabung menjadi tetramers untuk menghasilkan permutasi yang berbeda (M4, M3L, M2L2, ML3,
dan L4). Kombinasi dari subunit adalah disebut sebagai isozim, dan isozim memiliki perbedaan fisik dan
kinetik (Gambar.
4.5). Subunit sedikit berbeda dalam
komposisi asam amino, sehingga
dua isozim
dapat dipisahkan satu sama lain dengan elektroforesis.Bentuk tetrameric yang
terjadi pada otot dilambangkan M4, sedangkan di hati dilambangkan L4.
Pada sel darah merah, beberapa kombinasi dapat ditemukan.
Orang yang tidak memiliki gen yang mengarahkan sintesis dari bentuk M dari enzim yang dapat membawa pada glikolisis di hati mereka, tetapi pengalaman karena kelemahan otot mereka tidak memiliki enzim dalam otot.
Orang yang tidak memiliki gen yang mengarahkan sintesis dari bentuk M dari enzim yang dapat membawa pada glikolisis di hati mereka, tetapi pengalaman karena kelemahan otot mereka tidak memiliki enzim dalam otot.
Gambar. 4.5. Isozim mungkin dari
fosfofruktokinase
Ketika laju reaksi fosfofruktokinase
diamati di berbagai konsentrasi
substrat (fruktosa-6-fosfat), diperoleh
kurva sigmoidal khas enzim alosterik. ATP adalah efektor alosterik dalam reaksi. Tingginya kadar ATP menekan laju
reaksi, dan rendahnya tingkat ATP
merangsang
reaksi (Gambar. 4.6). Ketika ada ATP
tingkat tinggi dalam sel, banyak
dari energi kimia tersedia secepatnya dari hidrolisis ATP. Sel tidak perlu memetabolisme glukosa untuk energi, sehingga kehadiran ATP menghambat jalur glikolisis. Ada
juga yang lain, alosterik efektor
dari fosfofruktokinase. Ini efektor
adalah fruktosa-2,6-bifosfat.
Gambar.
6. Efek alosterik di fosfofruktokinase. Pada tinggi [ATP], fosfofruktokinase berperilaku kooperatif, dan plot aktivitas enzim berbanding [fruktosa-6- fosfat] adalah sigmoidal. Tinggi [ATP] sehingga menghambat PFK, penurunan afinitas enzim untuk fruktosa-6-fosfat.
Langkah 4. Fruktosa-1,6-bifosfat dipecah menjadi
dua fragmen tiga-karbon. Reaksi
Pembelahan itu adalah
kebalikan dari kondensasi aldol; enzim yang mengkatalisis disebut Aldolase.
Dalam enzim yang diisolasi dari sumber hewan, rantai dasar sisi dari sebuah residu lisin memainkan peran kunci penting
dalam mengkatalisis reaksi ini. Gugus
Tiol sistein ini juga bertindak sebagai dasar reaksi ini.
Langkah
5. Dihidroksiaseton fosfat diubah menjadi gliseraldehida-3- fosfat.
Enzim yang mengkatalisis reaksi ini adalah triosephosphate isomerase. (Kedua dihidroksiaseton dan gliseraldehida adalah triosa.)
Satu
molekul gliseraldehida-3-fosfat telah
diproduksi oleh reaksi Aldolase, kami
sekarang memiliki molekul kedua dari gliseraldehida-3-
fosfat, yang dihasilkan oleh reaksi triosephosphate
isomerase. Asli molekul glukosa, yang berisi enam atom karbon, kini telah
diubah untuk dua molekul gliseraldehida-3-fosfat,
masing-masing berisi tiga atom karbon.
Nilai ΔG untuk reaksi ini dalam kondisi fisiologis sedikit positif (2,41 kJ mol-1 atau 0,58 kkal mol-1). Mungkin tergoda untuk berpikir bahwa reaksi tidak akan terjadi dan glikolisis yang akan berhenti di langkah ini.
Nilai ΔG untuk reaksi ini dalam kondisi fisiologis sedikit positif (2,41 kJ mol-1 atau 0,58 kkal mol-1). Mungkin tergoda untuk berpikir bahwa reaksi tidak akan terjadi dan glikolisis yang akan berhenti di langkah ini.
Kita
harus ingat bahwa sama seperti ditambah reaksi yang melibatkan hidrolisis ATP
menambahkan nilai-nilai ΔG mereka bersama-sama untuk reaksi secara keseluruhan, glikolisis terdiri dari banyak reaksi yang nilai ΔG sangat negatif yang dapat mendorong reaksi sampai selesai. Sebuah reaksi glikolisis memiliki sedikit kecil, nilai-nilai ΔG positif (lihat Tabel. 4.1), tetapi empat reaksi harus sangat besar, nilai negatif, sehingga ΔG yang untuk seluruh proses adalah negatif.
menambahkan nilai-nilai ΔG mereka bersama-sama untuk reaksi secara keseluruhan, glikolisis terdiri dari banyak reaksi yang nilai ΔG sangat negatif yang dapat mendorong reaksi sampai selesai. Sebuah reaksi glikolisis memiliki sedikit kecil, nilai-nilai ΔG positif (lihat Tabel. 4.1), tetapi empat reaksi harus sangat besar, nilai negatif, sehingga ΔG yang untuk seluruh proses adalah negatif.
Gliseraldehida-3-fosfat Apakah dikonversi ke Piruvat
Pada
titik ini, sebuah molekul glukosa (senyawa enam karbon) yang masuk ke
jalur telah dikonversi menjadi dua molekul gliseraldehida-3-fosfat. Perlu diketahui bahwa di seluruh jalur dua molekul dari masing-masing tiga senyawa karbon mengambil bagian dalam setiap reaksi untuk setiap glukosa awal molekul. Gambar. 4.7 merangkum bagian kedua dari jalur, yang sering disebut sebagai fase hasil dari glikolisis, karena ATP diproduksi sebagai gantinya dari yang digunakan dalam fase ini.
jalur telah dikonversi menjadi dua molekul gliseraldehida-3-fosfat. Perlu diketahui bahwa di seluruh jalur dua molekul dari masing-masing tiga senyawa karbon mengambil bagian dalam setiap reaksi untuk setiap glukosa awal molekul. Gambar. 4.7 merangkum bagian kedua dari jalur, yang sering disebut sebagai fase hasil dari glikolisis, karena ATP diproduksi sebagai gantinya dari yang digunakan dalam fase ini.
Gambar. 4.7.
Fase kedua dari glikolisis
Langkah 6. Gliseraldehida-3-fosfat dioksidasi menjadi 1,3-bisfosfogliserat.
Reaksi
ini, reaksi karakteristik glikolisis, harus melihat lebih dekat. Ini melibatkan
penambahan gugus fosfat untuk gliseraldehida-3-fosfat
serta reaksi transfer elektron, dari gliseraldehida-3-fosfat
ke NAD+.
Reaksi setengah dari oksidasi adalah
dari aldehid menjadi gugus asam karboksilat, di mana air dapat
dianggap untuk mengambil bagian dalam reaksi.
RCHO + H2O → RCOOH + 2H+ + 2e–
Reaksi setengah dari reduksi adalah NAD+ menjadi NADH.
NAD+ + 2H+ + 2e- → NADH + H+
Reaksi redoks keseluruhan adalah
RCHO + H2O + NAD+ → RCOOH + H+ + NADH
di mana R menunjukkan bagian masing-masing
dari molekul selain aldehida dan gugus asam
karboksilat. Reaksi oksidasi adalah eksergonik
di bawah kondisi standar (ΔG°' = -43,1 kJ mol-1 = -10,3 kkal mol-1),
tetapi oksidasi hanya bagian dari reaksi keseluruhan.
Gugus fosfat yang dihubungkan dengan gugus karboksil tidak membentuk ester,
karena sebuah hubungan membutuhkan ester
alkohol dan asam. Sebaliknya, gugus asam
karboksilat dan asam fosfat
membentuk campuran anhidrida dua asam
akibat hilangnya air,
3-fosfogliserat + Pi → 1,3-bisfosfogliserat + H2O
di mana zat yang terlibat dalam
reaksi berada dalam bentuk terionisasi yang sesuai pada pH 7. Perhatikan bahwa
ATP dan ADP tidak muncul dalam persamaan. Sumber dari gugus fosfat adalah ion fosfat itu sendiri, bukan ATP. Reaksi fosforilasi adalah endergonik
dalam kondisi standar (ΔG°' = 49,3 kJ
mol-1 = 11,8 kkal mol-1).
Reaksi
secara keseluruhan, termasuk transfer elektron dan fosforilasi, adalah
Mari kita
menunjukkan dua reaksi yang membentuk reaksi ini.
Perubahan
energi bebas standar untuk reaksi keseluruhan adalah jumlah dari nilai
untuk reaksi oksidasi dan fosforilasi. Reaksi keseluruhan tidak jauh dari keadaan kesetimbangan, karena hanya sedikit endergonik.
untuk reaksi oksidasi dan fosforilasi. Reaksi keseluruhan tidak jauh dari keadaan kesetimbangan, karena hanya sedikit endergonik.
ΔG°'keseluruhan = ΔG°' oksidasi + ΔG°'fosforilasi
= (-43,1 KJ mol-1) + (49,3 kJ mol-1)
= 6,2 kJ mol-1 = 1,5 kkal mol-1
Nilai perubahan energi bebas standar
ini untuk reaksi satu mol gliseraldehida-3-fosfat,
nilai tersebut harus dikalikan dengan 2 untuk mendapatkan nilai untuk setiap
mol glukosa (ΔG°' = 12,4 kJ mol-1 = 3,0 kkal mol-1). ΔG dibawah
kondisi selular sedikit negatif (-1,29 kJ mol-1 atau -0,31 kkal mol-1)
(Tabel. 4.1). Enzim yang mengkatalisis konversi gliseraldehida-3-fosfat menjadi 1,3-bisfofogliserat
adalah gliseraldehida-3-fosfat
dehidrogenase. Enzim ini adalah salah satu dari kelas enzim yang sama, NADH-terkait dehidrogenase. Struktur
dari sejumlah dehidrogenase jenis ini
telah dipelajari melalui kristalografi sinar-X. Struktur keseluruhan sangat tidak
mirip, tetapi struktur tempat pengikatan NADH sangat mirip dalam semua enzim (Gambar.
4.8). (Agen pengoksidasi adalah NAD+, baik bentuk teroksidasi dan rediksi
dari koenzim-pengikat untuk enzim). Salah satu bagian dari
situs pengikatan spesifik
untuk cincin nikotinamida, dan satu porsi khusus untuk cincin
adenin.
Gambar. 8. Skema gambaran
pengikat situs
dari NADH-pengait dehidrogenase. Ada situs
pengikatan spesifik untuk adenin
nukleotida
bagian dari koenzim (ditunjukkan warna
merah di
sebelah kanan garis putus-putus) dan untuk nikotinamida bagian dari koenzim (ditunjukkan warna kuning di sebelah kiri garis putus-putus), selain untuk tempat pengikatan substrat. Interaksi tertentu dengan enzim memegang substrat
dan koenzim dalam posisi yang tepat. Interaksi situs digambarkan
dengan serangkaian
garis hijau pucat.
Molekul
dari gliseraldehida-3-fosfat
dehidrogenase adalah tetramer,
yang terdiri dari empat subunit identik. Setiap subunit mengikat satu molekul
NAD+, dan setiap subunit berisi residu sistein penting. Sebuah thioester melibatkan residu sistein
adalah perantara penting dalam reaksi ini. Pada fosforilasi langkah, thioester
bertindak sebagai energi menengah tinggi. Ion fosfat menyerang thioester, membentuk campuran anhidrida asam karboksilat dan fosfat, yang juga merupakan energi
tinggi senyawa (Gambar. 4.9). Senyawa ini adalah 1,3-bisfosfogliserat, yang merupakan produk reaksi. Produksi ATP
membutuhkan senyawa energi tinggi sebagai bahan awal. 1,3-bisfosfogliserat memenuhi persyaratan ini dan transfer gugus fosfat ke ADP dalam reaksi yang sangat eksergonik (yaitu, ia memiliki potensi transfer
gugus fosfat yang tinggi).
Gambar.
4.9. Peran
residu sistein aktif di gliseraldehida-3-fosfat dehidrogenase. ion fosfat menyerang turunan thioester dari gliseraldehida-3-fosfat dehidrogenase menghasilkan 1,3-bisfosfogliserat dan untuk membentuk
gugus tiol dari sistein.
Langkah 7.
Langkah berikutnya adalah salah satu dari dua reaksi di mana ATP dihasilkan fosforilasi
ADP.
Enzim
yang mengkatalisis reaksi ini adalah fosfogliserat
kinase. Sekarang kinase akrab
sebagai nama generik untuk kelas ATP tergantung transfer gugus fosfat enzim. Fitur yang paling mencolok
dari reaksi harus dilakukan dengan energetika transfer gugus fosfat. Pada
langkah ini dalam glikolisis, gugus fosfat ditransfer dari 1,3-bisfosfogliserat ke molekul ADP, menghasilkan ATP, yang pertama dari dua
reaksi tersebut di jalur glikolisis. Telah menyebutkan bahwa 1,3-bisfosfogliserat dapat dengan mudah mentransfer
gugus fosfat untuk zat lain. Perhatikan bahwa substrat, yaitu 1,3-bisfosfogliserat, telah mentransfer
gugus fosfat ke ADP. Transfer ini khas dari substrat tingkat fosforilasi. Hal ini harus dibedakan
dari fosforilasi oksidatif, yakni transfer
gugus fosfat terkait dengan reaksi transfer elektron dimana oksigen adalah akseptor
utama elektron. Satu-satunya persyaratan untuk substrat tingkat fosforilasi adalah energi bebas standar
reaksi hidrolisis lebih negatif untuk hidrolisis senyawa fosfat baru yang
terbentuk. Ingat bahwa energi bebas standar hidrolisis 1,3-bisfosfogliserat adalah -49,3 KJ mol-1. Kita telah melihat bahwa
energi bebas standar hidrolisis ATP adalah -30,5 kJ mol-1, dan kita
harus mengubah tanda dari perubahan energi bebas ketika reaksi balik terjadi:
ADP + Pi + H+ → ATP + H2O
ΔG°'= 30,5 kJ mol-1 = 7,3 kkal mol-1
Reaksi keseluruhan adalah
1,3-bisfosfogliserat + ADP →
3-phosphoglycerate + ATP
ΔG°'= -49,3 kJ mol-1 + 30,5 kJ mol-1 =
-18,8 kJ mol-1 = -4,5 kkal mol-1
Dua
molekul ATP diproduksi oleh reaksi untuk setiap molekul glukosa yang memasuki
jalur glikolisis. Pada tahap jalur awal, dua molekul ATP diinvestasikan untuk
menghasilkan fruktosa-1,6-bifosfat,
dan sekarang mereka telah ditemukan. Pada titik ini, sisa penggunaan ATP dan
produksi yakni sama. Reaksi mendatang akan membawa produksi dari dua molekul
ATP sisa untuk setiap molekul glukosa awal, yang menyebabkan kelebihan sebesar
dua molekul ATP dalam glikolisis.
Langkah 8.
Kelompok fosfat ditransfer dari karbon 3 sampai karbon 2 dari rantai utama asam
gliserat, persiapan untuk reaksi yang berikut. Enzim yang mengkatalisis reaksi
ini adalah fosfogliseromutase.
Langkah 9.
Molekul 2-fosfogliserat kehilangan
satu molekul air, yang merupakan reaksi dehidrasi memproduksi fosfofenolpyruvat. Reaksi ini tidak
melibatkan transfer elektron. Enolase, enzim yang mengkatalisis ini reaksi,
membutuhkan Mg2+ sebagai kofaktor. Molekul air yang dihilangkan
mengikat Mg2+ dalam reaksi.
Langkah 10. Phosphoenolpyruvate transfer gugus fosfat untuk ADP, menghasilkan
ATP dan piruvat.
Ikatan rangkap bergeser ke oksigen pada karbon 2 dan hidrogen sudah bergeser ke karbon
3. Fosfoenolpiruvat merupakan senyawa berenergi tinggi dengan mentransfer gugus fosfat potensial tinggi. Energi bebas dari hidrolisis senyawa ini lebih negatif dibandingkan dengan ATP (-61,9 kJ mol-1 banding -30,5 kJ mol-1, atau -14,8 kkal mol-1 banding -7,3 kkal mol-1). Reaksi yang terjadi dalam langkah ini dapat dianggap sebagai jumlah dari hidrolisis fosfoenolpiruvat dan fosforilasi ADP. Reaksi ini adalah contoh lain dari substrat tingkat fosforilasi.
Fosfoenolpiruvat → Piruvat + Pi
ΔG°'= -61,9 kJ mol-1 = -14,8 kkal mol-1
ADP + Pi → ATP
ΔG°'= 30,5 kJ mol-1 = 7,3 kkal mol-1
Reaksi keseluruhan adalah
Fosfoenolpiruvat + ADP → Piruvat + ATP
ΔG°' = -31,4 kJ mol-1 = -7,5 kkal mol-1
Setiap dua mol piruvat yang
dihasilkan untuk setiap mol glukosa, energi dilepaskan untuk setiap mol bahan
awal sebanyak dua kali. Piruvat kinase
adalah enzim yang mengkatalisis reaksi ini. Seperti fosfofruktokinase, merupakan enzim alosterik yang terdiri dari empat subunit yang berbeda dari dua
jenis (M dan L), seperti yang kita lihat dengan fosfofruktokinase. Piruvat
kinase
dihambat oleh ATP. Konversi Fosfoenolpiruvat untuk piruvat memperlambat penurunan ketika sel memiliki konsentrasi tinggi ATP berarti sel tidak memiliki kebutuhan besar untuk energi dalam bentuk ATP. Karena isozim yang berbeda dari piruvat kinase ditemukan dalam hati dibandingkan otot, kontrol glikolisis ditangani secara berbeda di kedua jaringan tersebut.
dihambat oleh ATP. Konversi Fosfoenolpiruvat untuk piruvat memperlambat penurunan ketika sel memiliki konsentrasi tinggi ATP berarti sel tidak memiliki kebutuhan besar untuk energi dalam bentuk ATP. Karena isozim yang berbeda dari piruvat kinase ditemukan dalam hati dibandingkan otot, kontrol glikolisis ditangani secara berbeda di kedua jaringan tersebut.
Salah
satu pertanyaan paling penting tentang setiap jalur metabolisme adalah poin control.
Persiapan bisa terhenti jika organisme memiliki kebutuhan yang mendesak untuk
produk mereka, yang menghemat energi untuk organisme. Dalam glikolisis, tiga
titik kontrol reaksi. Reaksi pertama glukosa menjadi glukosa-6-fosfat, dikatalisis oleh heksokinase, yang kedua, adalah produksi fruktosa-1 ,6-bifosfat, dikatalisis oleh fosfofruktokinase, dan yang terakhir adalah reaksi PEP ke piruvat, katalis yang berperan adalah oleh
piruvat kinase (Gambar. 4.10). Hal
ini sering diamati bahwa kontrol dilakukan dekat jalur awal dan akhir, serta
pada titik-titik yang melibatkan kunci intermediet
seperti fruktosa-1 ,6-bifosfat.
Ketika kita telah belajar lebih lanjut tentang metabolisme karbohidrat, kita
dapat kembali ke peran fosfofruktokinase
dan fruktosa-1 ,6-bifosfat dalam
regulasi beberapa jalur metabolisme karbohidrat.
Gambar. 10. Poin kontrol glikolisis
Metabolisme Piruvat Anaerobik
Reaksi akhir glikolisis anaerobik adalah penurunan piruvat untuk laktat.
Reaksi
ini juga eksergonik (ΔG°' = -25,1 kJ mol-1 = -6,0 kkal mol-1);
seperti sebelumnya, kita perlu mengalikan nilai ini dengan 2 sampai dihasilkan
energi untuk setiap molekul glukosa yang masuk ke jalur tersebut. Laktat
merupakan jalan buntu dalam metabolisme otot, tetapi dapat didaur ulang dalam
hati untuk membentuk glukosa piruvat dan bahkan oleh jalur glukoneogenesis
("sintesis baru glukosa"),
Laktat dehidrogenase (LDH) adalah enzim yang mengkatalisis reaksi ini. Seperti gliseraldehida-3-fosfat dehidrogenase,
LDH adalah NADH-pengait dehidrogenase
dan terdiri dari empat subunit. Ada dua jenis subunit, ditunjuk M dan H, yang
sedikit berbeda dalam komposisi asam amino. Tetramer struktur kuaterner dapat
bervariasi sesuai dengan jumlah relatif dari dua jenis subunit, menghasilkan mungkin
lima isozim. Dalam otot rangka manusia, terdominasi tetramer homogen dari jenis
M4, dan dalam jantung kemungkinan homogen lain, tetramer H4, adalah bentuk yang
dominan. Bentuk-M3H, M2H2, dan MH3- heterogen terjadi dalam serum darah. Sebuah
tes klinis yang sangat sensitif untuk penyakit jantung didasarkan pada
keberadaan bentuk isozymic berbagai
enzim ini. Jumlah relatif isozim H4 dan MH3 dalam serum darah meningkat drastis
setelah infark miokard (Serangan jantung) dibandingkan dengan serum normal. Isozim
yang berbeda memiliki sedikit perbedaan sifat kinetik karena komposisi subunit
mereka. Isozim H4 itu (juga disebut LDH 1) memiliki afinitas tinggi untuk
laktat sebagai substrat. Isozim M4 (LDH 5) ini allosterically (cenderung
alosterik) dihambat oleh piruvat. Perbedaan-perbedaan mencerminkan peran umum
isozim 'dalam metabolisme. Otot adalah jaringan sangat anaerob, sedangkan hati
tidak.
Pada
titik ini, orang mungkin bertanya mengapa pengurangan piruvat menjadi laktat (produk
terbuang pada organisme aerobik) adalah langkah terakhir dalam glikolisis
anaerobik, jalur yang menyediakan energi untuk organisme dengan oksidasi
nutrisi. Ada lain yang perlu dipertimbangkan tentang reaksi, yang melibatkan jumlah
relatif NAD+ dan NADH dalam sel. Setengah dari reaksi reduksi dapat tertulis
Piruvat + 2H+ + 2e-
→ Laktat
dan setengah dari reaksi oksidasi
adalah
NADH + H+ → NAD+
+ 2e- + 2H+
Reaksi keseluruhan adalah, seperti
yang kita lihat sebelumnya,
Piruvat + NADH + H+ →
Laktat + NAD+
NADH
yang dihasilkan dari NAD+ oleh oksidasi gliseraldehida-3-
fosfat sebelumnya digunakan dengan tidak ada perubahan dalam jumlah relatif dari NADH dan NAD+ di dalam sel (Gambar. 4.11). Regenerasi ini diperlukan di bawah kondisi anaerobik dalam sel sehingga NAD+ akan hadir untuk glikolisis lagi untuk mengambil tempat. Tanpa regenerasi ini, reaksi oksidasi pada organisme anaerobik akan segera berhenti karena kurangnya NAD+ untuk melayani sebagai oksidator agen dalam proses fermentasi. Produksi laktat membeli waktu untuk organisme mengalami metabolisme anaerob dan bergeser beberapa jauh dari beban otot ke hati, di mana glukoneogenesis dapat mengubah kembali laktat ke piruvat dan glukosa. Di sisi lain, NADH adalah agen reduksi sering ditemui di banyak reaksi, dan hilang pada organisme dalam produksi laktat. Metabolisme aerobik membuat lebih efesien penggunaan agen pereduksi ("kekuatan reduksi") seperti NADH karena konversi piruvat menjadi laktat tidak terjadi dalam metabolisme aerobik. NADH yang dihasilkan dalam tahap glikolisis menyebabkan produksi piruvat tersedia untuk digunakan dalam reaksi lain di mana agen reduksi diperlukan.
fosfat sebelumnya digunakan dengan tidak ada perubahan dalam jumlah relatif dari NADH dan NAD+ di dalam sel (Gambar. 4.11). Regenerasi ini diperlukan di bawah kondisi anaerobik dalam sel sehingga NAD+ akan hadir untuk glikolisis lagi untuk mengambil tempat. Tanpa regenerasi ini, reaksi oksidasi pada organisme anaerobik akan segera berhenti karena kurangnya NAD+ untuk melayani sebagai oksidator agen dalam proses fermentasi. Produksi laktat membeli waktu untuk organisme mengalami metabolisme anaerob dan bergeser beberapa jauh dari beban otot ke hati, di mana glukoneogenesis dapat mengubah kembali laktat ke piruvat dan glukosa. Di sisi lain, NADH adalah agen reduksi sering ditemui di banyak reaksi, dan hilang pada organisme dalam produksi laktat. Metabolisme aerobik membuat lebih efesien penggunaan agen pereduksi ("kekuatan reduksi") seperti NADH karena konversi piruvat menjadi laktat tidak terjadi dalam metabolisme aerobik. NADH yang dihasilkan dalam tahap glikolisis menyebabkan produksi piruvat tersedia untuk digunakan dalam reaksi lain di mana agen reduksi diperlukan.
Gambar. 4.11
Daur ulang NAD+ dan NADH dalam glikolisis anaerobik
Dua
reaksi lain yang berkaitan dengan jalur glikolisis menyebabkan produksi
etanol melalui fermentasi alkohol. Proses ini adalah salah satu alternatif piruvat. Dalam dua reaksi terlebih dulu dari yang mengarah pada produksi etanol, piruvat adalah dekarboksilasi (kehilangan karbon dioksida) untuk menghasilkan asetaldehida. Enzim yang mengkatalisis reaksi ini piruvat dekarboksilase.
etanol melalui fermentasi alkohol. Proses ini adalah salah satu alternatif piruvat. Dalam dua reaksi terlebih dulu dari yang mengarah pada produksi etanol, piruvat adalah dekarboksilasi (kehilangan karbon dioksida) untuk menghasilkan asetaldehida. Enzim yang mengkatalisis reaksi ini piruvat dekarboksilase.
Enzim
ini membutuhkan Mg2+ dan kofaktor adalah tiamin pirofosfat (TPP).
(Tiamin sendiri adalah vitamin B1.) Dalam TPP atom karbon antara nitrogen dan sulfur
dalam cincin tiazol (Gambar 17.12) sangat reaktif. Ia membentuk sebuah carbanion (ion dengan muatan negatif
pada atom karbon) dengan mudah, dan carbanion pada gilirannya menyerang gugus
karbonil dari piruvat untuk membentuk sebuah adduct/penambahan. Karbon dioksida memisahkan diri,
meninggalkan sebuah fragmen dua karbon terikat kovalen pada TPP. Ada pergeseran
elektron, dan fragmen dua-karbon memisahkan diri,
menghasilkan asetaldehida (Gambar.
4.13). Fragmen dua karbon yang terikat pada TPP kadang-kadang disebut
teraktifasi asetaldehida, dan TPP dapat ditemukan dalam beberapa reaksi dekarboksilasi.
Asetaldehida kemudian tereduksi untuk memproduksi etanol, dan, pada saat yang sama, satu molekul NADH teroksidasi menjadi NAD+ untuk setiap molekul etanol yang dihasilkan.
Asetaldehida + NADH+ → Etanol NAD+
Reaksi
reduksi dari fermentasi alkohol mirip dengan pengurangan piruvat menjadi laktat,
dalam arti bahwa ia menyediakan untuk daur ulang NAD+ dan dengan
demikian memungkinkan lebih lanjut reaksi oksidasi anaerobik (fermentasi).
Reaksi keseluruhan untuk fermentasi alkohol adalah
Glukosa + 2ADP 2Pi + 2H+ → 2 Etanol + 2ATP +
2CO2 + 2H2O
NAD+ dan NADH tidak
muncul secara eksplisit dalam persamaan reaksi keseluruhan. Hal ini penting bahwa
daur ulang NADH untuk NAD+ terjadi di sini, seperti halnya ketika laktat
yang dihasilkan, sehingga ada dapat lebih oksidasi anaerobik. Alkohol dehidrogenase, enzim yang
mengkatalisis konversi asetaldehida untuk etanol, mirip dengan laktat dehidrogenase dalam banyak hal. Yang paling mencolok kesamaannya
adalah keduanya NADH-terkait dehidrogenase, dan keduanya tetramer.
Gambar. 13. Mekanisme reaksi dekarboksilase
piruvat. Bentuk carbanion cincin tiazol dari TPP adalah sangat nukleofilik.
carbanion ini menyerang karbon karbonil dari piruvat
untuk membentuk sebuah adduct. Karbon dioksida membagi keluar,
meninggalkan fragmen dua-karbon (aktifasi asetaldehida) terikat kovalen pada koenzim. Pergeseran dari elektron mengarah ke asetaldehida, regenerasi carbanion
tersebut.
Energi Produksi di Glikolisis
Proses keseluruhan dari glikolisis adalah eksergonik. Bisa dihitung ΔG°' untuk seluruh reaksi dengan menjumlahkan nilai-nilai ΔG°' dari setiap langkah. Ingat bahwa semua reaksi dari isomerase fosfat triose untuk piruvat kinase yang dua kali lipat memberikan angka akhir dari glukosa untuk dua piruvat dari -74,0 kJ mol-1 atau -17,5 kkal mol-1. Energi yang dilepaskan pada fase eksergonik dari proses mendorong reaksi endergonik. Reaksi keseluruhan glikolisis secara eksplisit mencakup proses endergonik penting, bahwa fosforilasi dari dua
molekul ADP.
2ADP + 2Pi → 2ATP
ΔG°'
reaksi = 61,0 kJ mol-1 = 14,6 kkal mol-1 glukosa terpakai
Tanpa produksi ATP, reaksi satu
molekul glukosa untuk menghasilkan dua molekul piruvat akan lebih eksergonik.
Dengan demikian, pengurangan ke luar sintesis ATP:
Glukosa + 2ADP + 2Pi → 2 Piruvat + 2ATP ΔG°' = -73,4 kJ mol-1 -17,5 kkal mol-1
- (2 - ATP + 2Pi → 2 ATP) ΔG°' = -61,0 kJ mol-1 -14,6 kkal
mol-1
______________________________________________________________________
Glukosa → 2 Piruvat ΔG°' =
-134,4 kJ mol-1
= -32,1 Kkal mol-1
glukosa terpakai
(Angka yang sesuai untuk konversi satu mol glukosa menjadi dua mol laktat adalah -184,6 kJ mol-1 = -44,1 kkal mol-1.) Tanpa produksi ATP, energi yang dilepaskan oleh konversi glukosa menjadi piruvat akan hilang untuk organisme dan hilang sebagai panas. Energi yang dibutuhkan untuk menghasilkan dua molekul ATP untuk setiap molekul glukosa dapat dipulihkan oleh organisme ketika ATP dihidrolisis dalam beberapa proses metabolisme. Persentase energi yang dilepaskan oleh pemecahan glukosa menjadi laktat yang "ditangkap" oleh organisme ketika
ADP menjadi ATP terfosforilasi adalah efesiensi penggunaan energi dalam glikolisis, yang merupakan (61.0/184.6) x100, atau sekitar 33%. Itu berasal dari menghitung energi yang digunakan untuk memfosforilasi dua mol ATP sebagai persentase dari energi yang dilepaskan oleh konversi satu mol glukosa menjadi dua mol laktat. Pelepasan keseluruhan energi dalam glikolisis, 123,6 kJ (29,5 kkal) untuk setiap mol glukosa diubah menjadi laktat, didisipasikan sebagai panas oleh organisme. Tanpa produksi ATP untuk penyedia sumber energi untuk proses metabolisme lainnya, energi yang dilepaskan oleh glikolisis tidak akan bermanfaat untuk organisme, kecuali untuk membantu menjaga suhu tubuh di hewan berdarah panas.
Perubahan energi bebas yang telah dibahas dalam pada bagian ini adalah nilai-nilai standar, dengan asumsi kondisi standar, seperti konsentrasi 1 M dari semua zat terlarut kecuali ion hidrogen. Konsentrasi dalam kondisi fisiologis dapat berbeda nyata dari nilai-nilai standar. Untungnya, ada metode terkenal untuk menghitung perbedaan dalam perubahan energi bebas. Juga, perubahan besar dalam konsentrasi yang sering menyebabkan perbedaan yang relatif kecil dalam perubahan energi bebas, sekitar beberapa kilojoule per mol. Beberapa energi bebas
perubahan yang mungkin berbeda dalam kondisi fisiologis dari nilai-nilai tercantum di sini untuk kondisi standar, tetapi prinsip-prinsip yang mendasari dan kesimpulan yang diambil tetap sama.
No comments:
Post a Comment